Тема разреженных матриц уже всплывала в обсуждении, но тема эта вечная.
В первую очередь вспомнился GPU Contest от Мэрилендского университета, однако победитель там объявлен, а вот посмотреть внимательно на код - негде (на сайте не нашел, гуглом не нашел). Подписался на их ньюсгруппу в надежде почитать, но она модерируемая и меня пока не одобрили.