clock() возвращает значение счетчика тактов того мультипроцессора, на котором работает поток.
А в примере из SDK разница между maxEnd и minStart дает время работы всего kernel-а в целом, т.е. после прохода по циклу for в строках 6-10 в minStart содержится значение такта, в котором начал работать первый по времени запуска блок, а в maxEnd - значение такта, в котором закончил работать последний повремени завершения блок.